El héroe perdido narra la historia de Jason, el cual se despierta desorientado sin saber el lugar en el que se encuentra. Siente que algo va muy mal, y el hecho de no recordar nada de su pasado no es de gran ayuda en ese momento. Está en un autobús de camino a un campamento para chicos problemáticos en el Gran Cañon, y junto a él le acompañan Piper, una chica que dice ser su novia y Leo, un chico que dice ser su mejor amigo. Pero al igual que el resto de sus recuerdos, estos datos tampoco los recuerda, ni siquiera las caras de todos los chicos. Pero más pronto que tarde tanto Jason, como Piper y Leo descubrirán que no están allí por casualidad.
Los tres no solo van a saber que son hijos de dioses del Olimpo sino también que su destino será cumplir una gran profecía, la más peligrosa y dura que haya podido ocurrir durante toda la historia. Dicha profecía será liberar a la diosa de la furia Hera que ha sido raptada por un enemigo que lleva mucho tiempo planeando su venganza. Pero para ello, primero tendrán que llegar al Campamento Mestizo junto a Annabeth, una de las líderes, y una vez allí tendrán que reconocerlos como semidioses. Sin embargo, Annabeth nota algo raro en el comportamiento de Jason, no solamente por su manera de hablar latín, también en el modo que tiene de referirse a los dioses con sus nombres en romano. Aún así, muy pronto se resolverán muchas incógnitas que serán de gran ayuda para todos los obstáculos que les esperan para superar la peor de las profecías jamás creadas.